Структурная биология - активно развивающаяся область, использующаяся в других разделах биологии, в медицине и в фармакологии. В последнее время в нее активно проникают подходы, основанные на машинном обучении. Оно используется для обработки экспериментальных данных (ЯМР, РСА, криогенная микроскопия), генерации новых веществ, анализа результатов докинга, предсказания белок-белковых взаимодействий, предсказания свойств и токсичности для человека химических веществ. Также машинное обучение используется для ускорения традиционных подходов структурной биологии таких как молекулярная динамика и квантово-механическое моделирование.
Основной задачей курса «Машинное обучение в структурной биологии» является ознакомление слушателей как с классическими подходами структурной биологии, так и с их аналогами, построенными на основе машинного обучения.
Продолжительность курса: 1 семестр (6 теоретических и 6 практических занятий).
Курс ориентирован на магистров и аспирантов биологических и химических специализаций. В ходе данного курса слушатели ознакомятся с теоретическими основами классических и ML-подходов в структурной биологии, а затем на практике их применят, смогут сравнить полученные результаты.
В результате прохождения курса слушатели смогут самостоятельно ставить задачи на языке структурной биологии и решать их новейшими методами.
msu.vsb.ai@gmail.com
Занятия проводятся на Факультете Биоинженерии и биоинформатики.
В программе курса 12 занятий по вторникам с 17:10 до 18:55.
Лекции и семинары будут чередоваться - сначала лекция, затем семинар по ней.
Требования к студентам
- Знание Python и некоторых ML-библиотек;
- Курсы молекулярной биологии, классическая физика, органическая химия.
Страница курса на платформе Teach-in
В настоящий момент набор на курс 2021 года закрыт.
Набор на второй поток факультатива будет производиться в сентябре 2022 года.
Детальная информация о записи на курс и расписании занятий будет размещена дополнительно.