Структурная биология - активно развивающаяся область, использующаяся в других разделах биологии, в медицине и в фармакологии. В последнее время в нее активно проникают подходы, основанные на машинном обучении. Оно используется для обработки экспериментальных данных (ЯМР, РСА, криогенная микроскопия), генерации новых веществ, анализа результатов докинга, предсказания белок-белковых взаимодействий, предсказания свойств и токсичности для человека химических веществ. Также машинное обучение используется для ускорения традиционных подходов структурной биологии таких как молекулярная динамика и квантово-механическое моделирование.
Основной задачей курса «Машинное обучение в структурной биологии» является ознакомление слушателей как с классическими подходами структурной биологии, так и с их аналогами, построенными на основе машинного обучения.
Продолжительность курса: 1 семестр (6 теоретических и 6 практических занятий).
Курс ориентирован на магистров и аспирантов биологических и химических специализаций. В ходе данного курса слушатели ознакомятся с теоретическими основами классических и ML-подходов в структурной биологии, а затем на практике их применят, смогут сравнить полученные результаты.
В результате прохождения курса слушатели смогут самостоятельно ставить задачи на языке структурной биологии и решать их новейшими методами.
Преподаватели курса:
Головин Андрей Викторович
Образование
Химия
Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова
Специализация
Химия и компьютерное моделирование биоструктур
Пензар Дмитрий Дмитриевич
Образование
Биоинженерия и биоинформатика
Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова
Специализация
Биоинформатика, статистическая обработка данных, машинное обучение в биологии
Занятия проводятся на Факультете Биоинженерии и биоинформатики.
В программе курса 12 занятий по вторникам с 17:10 до 18:55.
Лекции и семинары будут чередоваться - сначала лекция, затем семинар по ней.
Требования к студентам
Страница курса на платформе Teach-in
В настоящий момент набор на курс 2021 года закрыт.
Набор на второй поток факультатива будет производиться в сентябре 2022 года.
Детальная информация о записи на курс и расписании занятий будет размещена дополнительно.
ПО ПЯТНИЦАМ
09:00–10:30 1 пара
10:40–12:10 2 пара
12:10–13.00 Перерыв
13:00–14:30 3 пара
14:40–16:10 4 пара
Преподаватель: А. А. Ганичев
ПО ЧЕТВЕРГАМ
09:00–10:30 1 пара
10:40–12:10 2 пара
12:10–13.00 Перерыв
13:00–14:30 3 пара
14:40–16:10 4 пара
Преподаватель: А. П. Маракулин
ПО ПОНЕДЕЛЬНИКАМ
09:00–10:30 1 пара
10:40–12:10 2 пара
12:10–13.00 Перерыв
13:00–14:30 3 пара
14:40–16:10 4 пара
Преподаватель: Д. Д. Пензар
ПО СУББОТАМ
09:00–10:30 1 пара
10:40–12:10 2 пара
12:10–13.00 Перерыв
13:00–14:30 3 пара
14:40–16:10 4 пара
Преподаватель: И. А. Конюшок
